Wapń powinien pozostawać w organizmie zwierzęcia w odpowiedniej ilości, mieszcząc się w tzw. widełkach referencyjnych (dla każdego gatunku są one nieco inne). Niedobór tego pierwiastka (hipokalcemia) często przez długi czas nie daje zewnętrznych objawów, bo organizm czerpie z rezerw w postaci własnych kości. Prowadzi to w konsekwencji do osłabienia szkieletu, a dodatkowe objawy to zaburzenia pracy ukł. nerwowego i mięśniowego, takie jak drgawki, drżenia mięśniowe, skurcze mięśni czy napady padaczkowe. Szczególnym przypadkiem niedoborów wapnia jest tężyczka poporodowa (spotykana najczęściej u suk małych ras i rzadziej u kotek), która jest efektem zbyt dużej ilości wapnia przekazanej przez organizm matki młodym (m.in. w pierwszym mleku, jakim jest siara).
Z kolei nadmiar (hiperkalcemia) odbija się na pracy nerek, przewodu pokarmowego, układu krążenia oraz układu nerwowego. Zbyt wysoka podaż wapnia może prowadzić do nieodwracalnego zwapnienia w tkankach miękkich, w tym w naczyniach krwionośnych, nerkach, wątrobie czy mięśniach.